2016年02月18日 星期四 23:57:08

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Google發布AI新工具 有望快速確立療法

 

圖片來源:verily

近日,Google發布了一個名為DeepVariant的工具。這是由Google Brain團隊聯合同屬於Alphabet旗下的生命科學公司Verily,花了兩年多時間研發的開源(Open Source)工具。它使用最新的人工智慧(Artificial  Intelligence,AI)技術,能從測序數據中構建出比起以往更準確的人類基因體圖像。

該團隊從瓶中基因體聯盟(Genome in a Bottle Consortium,GIAB)收集了數百萬個完整的高通量測序基因體,將數據輸入到DeepVariant深度學習系統中,並精心調整模型的參數,直到學會高準確度解釋序列數據為止。

DeepVariant可將高通量測序讀數轉換為完整基因體的圖像,運用深度神經網路(deep neural networks,DNN)從DNA測序數據中快速精確識別鹼基變異位點。

圖像分類正是google擅長的技術;團隊將工作量巨大的拼接問題(高通量測序碎片化的結果拼接成完整的基因序列),轉變成一個典型的圖像分類問題,在準確度上,比傳統的比對拼接方法都高出一大截。

2016年,DeepVarient還在PrecisionFDA Truth Challenge中贏得了SNP最高性能獎(Highest SNP Performance)。在那之後,Google Brain團隊又將錯誤率降低了50%。

加拿大深度學習基因技術公司執行長Brendan Frey說,DeepVariant的成功非常重要,因為它證明了在基因體學中,深度學習(Deep Learning)可以用來自動訓練性能,使其優於復雜的手工系統。

此外,AI的影響將不僅僅是幫助基因體測序數據。Frey認為,目前阻斷藥物的不足在於我們無法準確地將遺傳變異與疾病機制進行對照,並利用這些資訊快速確定拯救生命的療法。AI是我們解釋和處理大數據的唯一技術,這將徹底改變醫學的未來。

往後,DeepVariant會在Google雲端平台上提供,以吸引任何想要使用最新AI技術的人。

 

參考:

Google Has Released an AI Tool That Makes Sense of Your Genome

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