2016年02月18日 星期四 23:57:08

掌握大中華市場脈動.亞洲專業華文生技產業月刊

《Nature》白血病最大資料庫  揭示急性髓性白血病功能基因組

2018/10/19彭梓涵編譯

Nature》白血病最大資料庫  揭示急性髓性白血病的功能基因組。(圖片來源:網路)

Nature》白血病最大資料庫 揭示急性髓性白血病的功能基因組。(圖片來源:網路)

奧勒岡健康與科學大學(OHSU)研究團隊收集了來自562名患者的672個腫瘤標本,利用全外顯子組定序、RNA定序和離體藥物敏感性分析來評估這些樣本;研究團隊發現過去未曾在急性髓性白血病(AML)中檢測到的突變事件,這些突變會影響藥物的使用。研究人員表示目前這個最大資料庫可用於解決AML生物學的臨床,基因組,轉錄組學和功能分析。相關研究日前已發表在《Nature》期刊上。

急性髓性白血病(AML)的存活率低,新診斷的患者中只有不到25%超過5年存活率。發展有效、有對性的AML療法一直以來具有挑戰性,因為AML不是單一疾病,會合併多種疾病併發症。因此,過去40年來,標準基本護理保持沒有太大的感變。故嶄新的治療方案的發展是有其必要性。

由OHSU癌症研究所與白血病和淋巴瘤協會(LLS)合作的Beat AML計畫,從2013年開始收集白血病相關的數據,研究團隊試著了解這些樣品的基因組定序和分子構成,以及腫瘤細胞如何在實驗室篩選中對各種藥物產生反應的訊息。

此計畫也集結了生物訊息學和計算生物學教授,由Shannon McWeeney博士領導了數據協調,分析和建模,並開發了一個Vizome數據可視化平台。

研究團隊先從最常見的33個突變基因開始檢視,結果顯示Beat AML與美國癌症基因體圖譜計畫(TCGA)顯示出的結果相似,但在一些剪接因子的突變在先前的AML中沒有觀察到相關的定序研究。

另外在藥物反應與基因表達,研究團隊也描繪了363例患者的409例樣本中的細胞使用離體藥物敏感性試驗,測試122種小分子抑製劑,其中有64種對樣本有影響,又以HDAC抑制劑(panobinostat)對transformed cases特別靈敏。研究團隊也建立了整個藥物敏感度的全視圖。

McWeeney博士表示,「龐大的高通量數據有可能壓倒科學家和臨床醫生,這項計畫需要新一代的科學計算方法和策略來管理、整合和可視化數據,從數據探索提出問題並開始尋求答案。」

 

資料來源:

Functional genomic landscape of acute myeloid leukaemia

Study involving hundreds of patient samples may reveal new treatment options of leukemia

 

相關報導

美國心臟協會:噪音環境增加心血管疾病風險... 噪音環境增加心血管疾病風險 (圖片來源: 網路)根據美國心臟協會近期的研究顯示,長期暴露在高分貝的噪音環境之中可能導致嚴重的心血管疾病。此結果於近(5)日公布於美國心臟協會網站。本研究由波士頓麻省總醫院(Massachusetts General Hospital)的Azar Radfar博士主導...
《Cell》總是吃不飽!? 胰泌素和棕色脂肪組織影響大腦飽食中樞... 《Cell》總是吃不飽!? 胰泌素和棕色脂肪組織影響大腦飽食中樞(圖片來源:Cell)日前(15),德國慕尼黑工業大學(Technical University of Munich)研究人員解釋了棕色脂肪(Brown adipose tissue, BAT)與小鼠腸道中的胰泌素(secretin)...
《Science》飲食大戰 攝取脂肪是敵是友!?... 飲食大戰 攝取脂肪是敵是友!?(圖片來源:網路)是低脂高醣的飲食健康還是高脂低醣的飲食健康呢?日前(15),哈佛大學研究人員表示每個人對飲食組成的反應均不相同,沒有特定的脂肪與碳水化合物的比例適合每個人,重點不在醣類與脂肪的比例,而在於攝取的種類。該文章發表於《Science》。 在肥胖治療與慢性...
為胖而憂鬱,還是為憂鬱而胖 為胖而憂鬱,還是為憂鬱而胖 (圖片來源:網路)肥胖與憂鬱之間的關聯千絲萬縷,其間的因果關係一直備受爭議。近日,來自英國艾希特大學(University of Exeter)的科學家與澳洲的研究人員合作就這個題目進行了一系列研究,透過大規模的基因組分析,他們發現肥胖的人具有更高的憂鬱風險。此結果於近...
《Science》子刊: 利用片段大小特徵增強對ctDNA的檢測分析... 《Science》子刊: 利用片段大小特徵增強對ctDNA的檢測分析。來自英國,丹麥,波蘭,荷蘭和瑞士的研究人員開發了一種新的癌症檢測方法透過觀察血液中循環的腫瘤DNA片段大小,根據其尺寸建立一個拷貝數中立的中位數絕對偏差度量指標t-MAD,以增強對ctDNA的檢測,測試結果顯示94%的乳腺癌,腸...
文章分類 科學要聞

發表迴響

未來活動

  1. 臺商回臺投資商機研討會

    十一月19日 13:30:00 - 17:30:00
  2. 大學光(3218)法人說明會(107/11/19)

    十一月19日 14:30:00 - 15:30:00
  3. 【CPMDA】細胞治療臨床試驗申請與執行研討會-系列二

    十一月20日 13:30:00 - 17:00:00
  4. 美時製藥(1795)國票證券投資論壇(107/11/20)

    十一月20日 13:30:00 - 14:30:00
  5. 國際農業科技論壇 Smart Agriculture Symposium

    十一月21日 08:30:00 - 17:00:00

Copyright© 2018 環球生技投資股份有限公司. All rights reserved.

讀者服務電話:(02)26521062  時間:週一 ~ 週五 9:00 ~ 18:00

服務信箱:service@gbimonthly.com

地址:115台北市南港區園區街6-9號1樓, Taiwan