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《Nature》20000次基因編輯 CRISPR大規模篩選癌症藥物候選基因

2019.04.15 環球生技雜誌/薛瀹熢 編譯

 

Wellcome Sanger Institute (圖片來源: Wellcome Sanger Institute)

Wellcome Sanger Institute (圖片來源: Wellcome Sanger Institute)

來自英國Wellcome Sanger研究所的科學家與多間製藥公司合作,使用CRISPR-Cas9基因編輯系統在超過30種不同癌症與300種癌症模型中篩選了近20000個基因,並整理出600個與癌細胞生存密切相關的候選基因名單,未來,這些基因將有潛力應用於藥物開發,幫助人類對抗那些最難以治療的癌症。他們的研究結果於10日發表於《Nature》。

英國Wellcome Sanger研究所與製藥公司葛蘭素史克(GSK)、EMBL-EBI及Open Targets共同進行本次研究。他們利用CRISPR在超過30種不同癌症與300種癌症模型中剔除近20000個基因,以測試那些基因對癌症生存有重要功能,他們所測試的癌症種類包含常見的肺癌,結直腸癌、乳癌,以及有強烈為滿足需求的卵巢癌、胰腺癌等。

科學家們透過實驗找到了數千個關鍵癌症基因。接著他們利用新開發的優先級系統(prioritization system)評估基因,並縮小列表範圍。最終,他們列出了600個有希望成為癌症藥物標靶的候選基因名單及順序。

來自Wellcome Sanger研究所和Open Targets的主要研究參與人員之一,Francesco Iorio博士表示,為了最佳化新藥開發的成功率,在藥物開發初期選擇最有潛力的藥物標靶至關重要。

「這個研究的強力之處在於它的規模。」英國癌症研究中心的首席科學家Karen Vousden說。「CRISPR提供了一個獨特的工具並加速了癌症藥物目標的研究,而這項研究正幫助我們朝著積極的方向邁出了一大步。」

「但我們應該記住,在實驗室中的細胞研究並不總能反映出人體內癌症的複雜性,因此不一定能正確反映出實際人類對藥物的反應。這項工作提供了我們一些很好的起點,接下來便是對本研究中被定為癌症弱點的基因進行全面分析,以確定他們是否有一天能夠開發成為患者的新治療選擇。」Vousden說。

除了列出候選基因,本次研究也將提供免費的資源供予其他科學家進行研究,並幫助科學家繪製癌症依賴關係圖(Cancer Dependency Map),這個計畫是一份精確癌症治療的詳細規則手冊,可幫助更多患者接受有效的治療。

「癌症依賴關係圖是一項巨大的計畫,目標是找出不同癌症中存在的所有弱點,因此我們可以利用這些資訊強化新一代癌症精準治療的效果。」來自Wellcome Sanger和Open Targets的研究共同主要作者Mathew Garnett說。

 

《Nature》

Prioritization of cancer therapeutic targets using CRISPR–Cas9 screens

 

參考資料:

Scientists use DNA-editing tool CRISPR to catalogue cancer’s weaknesses

CRISPR Ranks Top 600 Cancer Targets

文章分類 科學要聞

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