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Deep Genomics推出第一項AI探索候選藥物

2019.09.26 環球生技雜誌 / 記者 吳培安 編譯

Deep Genomics推出第一項AI探索候選藥物。(圖片來源: Deep Genomics官方網站)

今(美國時間25)日,加拿大AI新創公司Deep Genomics宣布其第一個藥物候選,鎖定在目前尚無根治方法的罕見疾病──威爾森氏症(Wilson’s disease),並預計在明年底提交IND。

Deep Genomics是當前備受注目的AI新藥探索(AI drug discovery)公司之一。它成立於2014年,正處於Atomwise、BenevolentAI、Recrusion、Insilico Medicine等同業紛紛成立的競爭時期,且都在遺傳疾病基礎上應用AI尋找候選藥物。

Deep Genomics執行長Brendan Frey表示,他們自2015年啟動AI Workbench平台,它搭載了20組機器學習(machine-learning)系統,可在兩個小時內可以掃描超過20萬個患者的基因突變。

經過為時1年半的探索,搜尋了2400種疾病、12萬種基因突變的資料庫,Deep Genomics將目標鎖定在威爾森氏症(Wilson’s disease)。

威爾森氏症是一種罕見的遺傳性疾病,威爾森氏症患者無法有效清除體內過量的銅,使得銅會累積在人體各處,造成肝臟、腎臟、腦部、眼睛等部位的毒性,若無妥善治療則會致命。目前僅知威爾森氏症可能與銅運輸蛋白ATP7B的突變有關,但因為了解尚不透徹,因此還沒有根治的療法。

根據Deep Genomics的AI系統預測結果,目前已知的突變位點應該不會影響ATP7B蛋白的功能,而是更為源頭的阻斷了細胞製造這種蛋白的指令,因此細胞根本無法製造這種蛋白,導致威爾森氏症的發生。

AI系統辨識出十幾個潛在的候選藥物,Deep Genomics經過實驗室的耐受性和藥動學試驗,最後宣布他們第一個候選藥物DG12P1,將在明年底送IND。

Deep Genomics表示,他們預計在今年再推出一個候選藥物,未來也將每年至少推出兩個候選藥物。

業界目前也正在關注Deep Genomics如何克服後續的挑戰,將這些候選藥物推向臨床試驗、乃至上市。

利用AI進行藥物探索,如今也成為AI新創公司爭相競逐的領域。例如,數週前發表新成果的Insilico Medicine,發表能在三週內找到3萬個針對纖維化疾病標靶DDR1的候選藥物,他們也擅長利用AI去改良現有的藥物;Atomwise,其強項在加速小分子藥物篩選,其系統能從100億個藥物分子中挑出安全性較高的兒童癌症候選藥物,完成需要數年才能完成的工作;Insitro則是聚焦於透過自動化實驗室搭配AI深度學習,預測臨床試驗受試者對藥物的反應結果。

不過,Deep Genomics執行長Brendan Frey也是受到同業Insilico Medicine研究員Alex Zhavoronkov推崇的科學家,「毫無疑問的,他在全世界將機器學習應用在生物領域的科學家中能夠名列前十;在加拿大,Frey也可說是最優秀的科學家。」

 

參考資料:

https://www.fiercebiotech.com/biotech/deep-genomics-reveals-its-program-first-ai-discovered-drug-candidate

文章分類 國際快訊

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