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非侵入性產前檢測新標記

「NIPT之父」盧煜明最新研究 在孕婦血漿中發現胎兒eccDNA

2020.01.09 環球生技雜誌記者/彭梓涵 編譯

非侵入性產前檢測新標記!「NIPT之父」盧煜明最新研究 在孕婦血漿中發現胎兒eccDNA

非侵入性產前檢測新標記!「NIPT之父」盧煜明最新研究 在孕婦血漿中發現胎兒eccDNA

日前,由「NIPT之父」香港中文大學盧煜明(Dennis Lo)教授發表的最新研究指出,可從孕婦血漿中鑑定出母親與胎兒的2種染色體外環狀DNA( extrachromosomal circular DNA,eccDNA ),可為非侵入性產前檢測(NIPT)提供新的生物標記物,未來也將探索與妊娠相關疾病如子癇前症與早產之間的關係。相關研究成果1月3日發表在《PNAS》期刊上。 

盧煜明團隊在非侵入性產前檢測及應用方面多年耕耘有成,早在1997年盧煜明就發表了《胎兒DNA存在於孕婦的血漿和血清中》,這項孕婦外周邊血中存在胎兒線性游離DNA的發現,令他的研究團隊開創了革命性非侵入性產前檢測,在人類重大出生缺陷預防控制領域有著傑出貢獻。 

不過,之前的研究主要是以線性DNA片段為主,儘管在小鼠和以前的人類中均觀察到血漿中的eccDNA,但尚未在孕婦中有相關研究。 

此次盧煜明團隊,從五名孕婦血漿中分離出eccDNA分子,並利用限制性內切酶MspI將其線性化後,利用Illumina的HiSeq 1500/2500平台對eccDNA分子進行定序。 

研究人員發現,eccDNA分子顯示出具有〜202和〜338 個鹼基大小的鋒值分佈,他們證實平均約202個鹼基對為胎兒來源的,而母親的則為338個鹼基對。 

不過研究團隊也懷疑,限制性內切酶MspI可能影響,eccDNA分析片段,因此他們在利用Tn5轉座酶(Transposase)標籤片段化的方法,再從另五名孕婦中的eccDNA分析,結果顯示,母親與胎兒eccDNA分子確實有大小之分,而利用標籤片段法可鑑定出更多eccDNA分子。 

研究人員也透過基因組定位發現,eccDNA集中在5’-UTR、外顯子區和CpG island區,證明環狀DNA不是從基因組中隨機產生,他們認為,母親血漿中的eccDNA比線性DNA具有獨特的分子特徵與生物穩定性。

論文中內容也表示,eccDNA有潛力發展成非侵入式產前檢測的新工具箱,未來也將探索eccDNA圖譜與妊娠相關疾病如子癇前症與早產之間的關係。 

資料來源:

 https://www.pnas.org/content/early/2020/01/02/1914949117

https://www.genomeweb.com/sequencing/circular-cell-free-dna-plasma-pregnant-women-may-serve-novel-biomarker

“History Doesn't Repeat Itself, but It Often Rhymes” – Mark Twain.

文章分類 科學要聞

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