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MIT張鋒出手!開發試紙型CRISPR-Cas13新冠病毒檢測法 1小時結果出爐

2020.02.17 環球生技雜誌 / 記者 吳培安 編譯

MIT張鋒出手!開發試紙型CRISPR-Cas13新冠病毒檢測法 1小時結果出爐 (圖片來源:本刊資料中心)

MIT張鋒出手!開發試紙型CRISPR-Cas13新冠病毒檢測法 1小時結果出爐 (圖片來源:本刊資料中心)

美國時間14日,麻省理工學院(MIT)張鋒等人宣布,其與MIT哈佛布洛德研究所(Broad Institute of MIT and Harvard)MIT麥戈文腦科學研究所(McGovern Institute for Brain Research, MIT)等合作機構,將一種應用CRISPR-Cas13技術、名為「SHERLOCK」系統的試紙型快速檢測法,應用在新型冠狀病毒(COVID-19)上。

根據此系統的操作流程,能夠在1小時內得知檢驗樣本中是否存在病毒RNA。研究團隊也聲明,目前這種方法還未經過確效和法規等開發程序,但樂意開放相關有益資訊,以幫助各界開發潛在的檢驗方式。

SHERLOCK是張鋒等人在20174月發表於《Science》的CRISPR檢驗方式,全名為Specific High-sensitivity Enzymatic Reporter unLOCKing。其選用Cas13a做為相關酶,預期能夠做為多種病原體、甚至耐藥性或癌症的檢測法。

其後在20184月,張鋒的研究團隊又將此技術進一步改良,成為僅需將試紙浸入特定處理後的樣本、就能如驗孕試紙般一目了然的試劑組,且不須使用昂貴的設備。SHERLOCK系統過去已經能在患者樣本中精準地偵測出多種病毒。

張鋒、Omar AbudayyehJonathan Gootenberg等人表示,他們已經開發出適合的RNA純化操作步驟,有助於利用SHERLOCK系統檢驗COVID-19。研究團隊表示,歡迎各界研究者與他們聯繫以尋求協助或指引,以提供初級試驗組(starter kit)做為系統測試。

研究團隊在麥戈文腦科學研究所網頁上宣稱,他們已經利用兩條能夠辨識出COVID-19 兩條RNA特徵片段的引導RNA (guide RNA),搭配Cas13蛋白於SHERLOCK系統中使用,並成功偵測出COVID-19病毒RNA操作流程包括三個步驟,整個流程約1小時,並且可以用現行定量反轉錄聚合酶連鎖反應(qPCR)使用的RNA樣本操作。相關操作流程細節及取得方式,已經提交給冷泉港的開放歸檔網站bioRxiv上。

研究團隊也強調,這項初始研究操作流程還沒有在患者樣本上測試過,仍有待後續改良、製造、測試和確效步驟。他們聲明,任何檢驗組都需要經過臨床階段的開發、確效,並遵循所有區域法規和最好的實務。

 

參考資料:

https://mcgovern.mit.edu/2020/02/14/enabling-coronavirus-detection-using-crispr-cas13-an-open-access-sherlock-research-protocol/

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